敦賀から先の最終目的地である新大阪駅への延伸計画は、現在もルート選定や着工に向けた議論が続いています。決定されている認可ルートは、敦賀から福井県小浜市を経由して京都駅地下を通り、新大阪駅へ至る「小浜・京都ルート」です。
しかし、京都地下深層トンネルの掘削に伴う環境アセスメント（地下水影響や残土処理問題）や、建設資材・人件費の高騰による総事業費の膨張など、クリアすべき課題が山積しています。一時は米原で東海道新幹線へ接続する「米原ルート」への変更案を推す声も一部から上がりましたが、国土交通省および与党プロジェクトチームは小浜・京都ルートを維持する方針を崩していません。
全線開業が実現すれば、富山・金沢・福井から関西圏へのダイレクトアクセスが復活し、東海道新幹線の代替バックアップ機能としても強力なインフラとなります。財源確保と工期短縮に向けた調整が、今後の最大の焦点です。
