鹿児島県内の公立高校入試において、吉田南中学校の卒業生は第1学区の幅広い選択肢へ進学しています。特に鶴丸高校、甲南高校、鹿児島中央高校といった市内公立普通科の上位進学校に対して、毎年確かな合格者を輩出しています。
また、普通科だけでなく、鹿児島工業高校や鹿児島商業高校などの専門学科、さらに鹿児島高校、樟南高校、鹿児島実業高校をはじめとする市内私立高校の特進コース・スポーツ推薦など、生徒一人ひとりの興味関心や適性に合わせた進路指導が徹底されています。中学校側の進路指導部では、定期テストや実力テストの分析をもとにした個別面談を綿密に実施しており、「無理な背伸びをさせず、かつ本人の可能性を引き出す手堅いサポート」として保護者層から高い信頼を得ています。
部活動に関しても、広大な敷地と恵まれた練習環境を活かした活動が目立ちます。陸上競技部や野球部、サッカー部、女子バレーボール部、卓球部などの運動部に加え、文化系では吹奏楽部などが熱心に活動しています。地域のスポーツ推進や文武両道を掲げる家庭が多く、部活動と高校受験に向けた学習のバランスが上手く保たれているのが特徴です。
